Ağrı İbrahim Çeçen Üniversitesi'nde eğitim sistemi, öğrencilere teorik ve pratik bilgiyi harmanlayarak sunmayı hedeflemektedir. Üniversitede, lisans, yüksek lisans ve doktora programları dâhil olmak üzere çeşitli düzeylerde eğitim verilmektedir. Eğitim müfredatları, alanında uzman akademik kadro tarafından oluşturulmakta ve güncellenmektedir. Öğrencilerin akademik gelişimlerini desteklemek amacıyla laboratuvarlar, kütüphaneler ve teknoloji ile donatılmış derslikler kullanılmaktadır. Üniversite, öğrencilere ulusal ve uluslararası düzeyde değişim programları aracılığıyla farklı kültürlerle tanışma ve farklı eğitim sistemlerini deneyimleme fırsatı sunmaktadır. Ayrıca, öğrencilerin kariyerlerini şekillendirmelerine yardımcı olmak için çeşitli staj ve iş birliği programları düzenlenmektedir. Eğitim sürecinde öğrencilere, disiplinler arası bir yaklaşım benimsenmekte ve eleştirel düşünme, problem çözme gibi becerilerin geliştirilmesine önem verilmektedir. Üniversite, sosyal sorumluluk projeleri ve toplumsal hizmetler aracılığıyla öğrencilerin topluma katkıda bulunmalarını teşvik etmektedir.