Amasya Üniversitesi'nde eğitim sistemi, öğrencilere teorik bilgi ile pratiği birleştiren bir anlayışla tasarlanmıştır. Üniversite, lisans, yüksek lisans ve doktora düzeylerinde geniş bir yelpazede programlar sunar. Eğitim dili Türkçe olup, bazı programlarda İngilizce dersler de bulunmaktadır. Üniversite, öğrencilerin akademik gelişimlerini desteklemek amacıyla çeşitli ders materyalleri, laboratuvar olanakları ve araştırma projeleri sunar. Öğrenciler, eğitim hayatları boyunca uygulamalı çalışmalara katılarak mesleki deneyim kazanırlar. Ayrıca, zorunlu ve seçmeli derslerden oluşan bir müfredat takip edilir ve öğrencilerin ilgi alanlarına göre seçim yapmalarına olanak tanınır. Dersler, genellikle dönemlik olarak planlanır ve öğrenciler, belirlenen krediler doğrultusunda derslerini tamamlar. Eğitim sistemi, öğrencilerin aktif katılımını teşvik eden seminerler, atölye çalışmaları ve proje bazlı öğrenme yöntemleri ile desteklenir. Ayrıca, üniversite bünyesinde sunulan staj programları ile öğrenciler, iş deneyimi kazanma fırsatına sahip olurlar. Öğrencilerin akademik başarısını değerlendirmek için ara sınavlar, final sınavları, proje ve ödevler gibi çeşitli değerlendirme yöntemleri kullanılır. Her ders için belirlenen başarı kriterleri doğrultusunda notlandırma yapılır ve öğrencilerin ders başarı durumları takip edilir. Amasya Üniversitesi, öğrencilerin küresel perspektif kazanmalarını sağlamak amacıyla Erasmus+ ve diğer uluslararası değişim programlarına katılım imkânı sunar. Bu sayede öğrenciler, yurtdışındaki üniversitelerde belirli süreler boyunca eğitim alarak farklı kültürleri tanıma ve uluslararası deneyim kazanma şansına sahip olurlar. Sonuç olarak, Amasya Üniversitesi'nin eğitim sistemi, öğrencilerin akademik ve mesleki becerilerini geliştirmeyi amaçlayan kapsamlı ve uygulamalı bir yapı üzerine kurulmuştur.
