Ardahan Üniversitesi'nin eğitim sistemi, öğrencilere teorik ve pratik bilgileri dengeli bir şekilde sunmayı amaçlamaktadır. Üniversite, lisans ve lisansüstü düzeyde geniş bir yelpazede programlar sunarak, farklı disiplinlerde eğitim fırsatları sağlamaktadır. Eğitim dili ağırlıklı olarak Türkçe olmakla birlikte, bazı programlarda İngilizce dersler de verilmektedir. Üniversite, öğrencilerin mesleki ve akademik gelişimlerini desteklemek için staj, proje ve uygulamalı derslere büyük önem vermektedir. Akademik takvim, güz ve bahar yarıyıllarından oluşmakta ve her yarıyıl sonunda öğrenciler, sınavlarla değerlendirilmektedir. Öğrencilere sunulan danışmanlık hizmetleri ile akademik başarılarının takip edilmesi ve kariyer planlamalarının desteklenmesi hedeflenmektedir. Ardahan Üniversitesi, öğrencilerin araştırma becerilerini geliştirmeleri için çeşitli laboratuvarlar, kütüphaneler ve araştırma merkezleri ile donatılmıştır. Ayrıca, öğrenci değişim programları ve uluslararası işbirlikleri aracılığıyla öğrencilere yurtdışında eğitim ve araştırma yapma imkânı sunulmaktadır.