Bayburt Üniversitesi, eğitim sistemi açısından kapsamlı ve öğrencilerin ihtiyaçlarına uygun bir yapı sunmaktadır. Üniversitenin eğitim programları, öğrencilerin hem teorik bilgilerini hem de pratik becerilerini geliştirmeye odaklanmaktadır. Bu amaçla, dersler laboratuvar çalışmaları, uygulamalı projeler ve saha çalışmaları ile desteklenmektedir. Müfredat, öğrencilerin kariyer hedeflerine ulaşmalarını sağlayacak şekilde düzenlenmiş olup, her bölümde alanında uzman akademisyenler tarafından verilmektedir.
Bayburt Üniversitesi'nde eğitim sistemi, lisans, yüksek lisans ve doktora programlarını kapsamakta olup, her seviyede öğrencilerin akademik ve kişisel gelişimlerine katkı sağlamak için tasarlanmıştır. Öğrenciler, eğitim süresince aldıkları derslerin yanı sıra çeşitli araştırma projelerine katılma ve uluslararası değişim programlarından yararlanma imkanına sahiptirler. Bu sayede, mezunlar hem ulusal hem de uluslararası düzeyde rekabet edebilecek bilgi ve becerilerle donatılmaktadır.