Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi'nde eğitim sistemi, öğrencilere teorik bilgi ile uygulamalı deneyimi bir arada sunmayı hedeflemektedir. Üniversitede lisans, yüksek lisans ve doktora düzeyinde çeşitli programlar bulunmaktadır. Eğitim-öğretim faaliyetleri, Bologna sürecine uyumlu olarak Avrupa Kredi Transfer Sistemi (AKTS) çerçevesinde yürütülmektedir. Bu sistem, öğrencilerin aldıkları ders kredilerinin uluslararası düzeyde tanınmasını sağlamaktadır. Ders programları, alanında uzman akademik kadro tarafından sunulmakta ve öğrencilerin bağımsız araştırma yapabilme, eleştirel düşünme ve problem çözme yeteneklerini geliştirmeye yönelik tasarlanmaktadır. Ayrıca, öğrencilerin pratik becerilerini artırmak amacıyla staj ve proje çalışmaları teşvik edilmektedir. Üniversite, öğrencilerin mezun olduktan sonra iş hayatına daha iyi hazırlanabilmeleri için kariyer planlama ve danışmanlık hizmetleri de sunmaktadır. Eğitim sürecinde, çeşitli seminerler, konferanslar ve atölye çalışmaları düzenlenerek öğrencilerin akademik ve kişisel gelişimleri desteklenmektedir.