İstanbul Topkapı Üniversitesi, 21 Nisan 2009 tarihinde Bakanlar Kurulu kararı ile Plato Meslek Yüksekokulu adıyla ve dört bölümle kurulmuştur. Üniversite, Ayvansaray Eğitim Vakfı tarafından yürütülen çalışmalar kapsamında, farklı alanlarda uzman profesyoneller yetiştirme ve lisans eğitimi verme amacıyla 24 Kasım 2016 tarihinde Resmi Gazete'de yayımlanan 6761 sayılı kanun ile İstanbul Ayvansaray Üniversitesi adı altında yeniden yapılandırılmıştır. Plato Meslek Yüksekokulu da 2016 yılında İstanbul Ayvansaray Üniversitesi'ne bağlanmıştır. Öğrenci memnuniyeti ve büyüme doğrultusunda, başlangıçta dört bölümle sunulan eğitim hizmetleri 2016 yılına kadar 60'dan fazla programa genişlemiştir.
Yenilenme ve uluslararasılaşma misyonu çerçevesinde, İstanbul Ayvansaray Üniversitesi, 11 Mart 2022 tarihinde Resmi Gazete'de yayımlanan 7382 sayılı kanun ile İstanbul Topkapı Üniversitesi olarak adını değiştirmiş ve eğitim-öğretim faaliyetlerine bu ad altında devam etmektedir. 2009 yılında tek bir bina ile başlayan eğitim faaliyetleri, 2022 yılında beş kampüse ve yaklaşık 100.000 metrekare alana yayılmıştır.
İstanbul Topkapı Üniversitesi bünyesinde; Güzel Sanatlar, Tasarım ve Mimarlık Fakültesi, Mühendislik Fakültesi, İktisadi, İdari ve Sosyal Bilimler Fakültesi, Spor Bilimleri Fakültesi, Sağlık Bilimleri Fakültesi, Lisansüstü Eğitim Enstitüsü ve Plato Meslek Yüksekokulu bulunmaktadır. Üniversite, şu an 25 yüksek lisans ve doktora programı, 35 lisans bölümü ve 56 ön lisans programıyla eğitim vermektedir. Hedefi, girişimcilik kültürünü benimsemiş, özgüveni yüksek ve iş dünyasına katkı sağlayacak mezunlar yetiştirmektir.
Üniversitenin Kazlıçeşme Yerleşkesi'nde Mühendislik Fakültesi, İktisadi, İdari ve Sosyal Bilimler Fakültesi, Plato Meslek Yüksekokulu ve Lisansüstü Eğitim Enstitüsü; Balat Yerleşkesi'nde Güzel Sanatlar, Tasarım ve Mimarlık Fakültesi; Şişli Yerleşkesi'nde Gastronomi ve Mutfak Sanatları Bölümü ve Aşçılık Programı; Levent Yerleşkesi'nde Spor Bilimleri Fakültesi yer almaktadır. Ayrıca, Yenibosna Yerleşkesi'nde Uzaktan Eğitim Merkezi bulunmaktadır.