Maltepe Üniversitesi, çeşitli fakülteler ve yüksekokullar bünyesinde lisans ve önlisans programları sunmaktadır. Eğitim sistemi, teorik derslerin yanı sıra uygulamalı eğitimlerle desteklenmektedir. Öğrenciler, laboratuvar çalışmaları, stajlar ve proje çalışmaları gibi uygulamalı eğitimlerle mesleki deneyim kazanmaktadır. Ayrıca, öğrencilere çift anadal ve yan dal yapma imkanı sunulmaktadır. Bu programlar sayesinde öğrenciler, ana dallarının yanı sıra ilgi duydukları diğer alanlarda da eğitim alarak çok yönlü bir bilgi birikimine sahip olabilmektedir. Çift anadal ve yan dal programlarına başvurular, belirli akademik başarı kriterlerine göre değerlendirilmektedir.
Maltepe Üniversitesi, uzaktan eğitim olanakları ile öğrencilere esnek bir eğitim sistemi sunmaktadır. Uzaktan Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi, internet tabanlı teknolojiler kullanarak öğrencilere ders materyallerine ve eğitim içeriklerine online olarak erişim imkanı sağlamaktadır. Bu sayede, zaman ve mekan kısıtlamaları olmadan eğitim alma fırsatı sunulmaktadır. Üniversite, Erasmus+ programı kapsamında öğrencilere yurt dışında eğitim ve staj yapma imkanları sunmaktadır. Bu program, öğrencilerin farklı kültürleri tanımasını ve uluslararası deneyim kazanmalarını sağlamaktadır. Maltepe Üniversitesi'nin Avrupa'daki birçok üniversite ile işbirliği anlaşmaları bulunmaktadır.
Maltepe Üniversitesi'nin Öğrenci Bilgi Sistemi, öğrencilere akademik takvim, ders programları, sınav tarihleri ve not bilgileri gibi akademik bilgilere online olarak erişim imkanı sağlamaktadır. Öğrenciler, bu sistem üzerinden kayıt işlemlerini gerçekleştirebilir ve çeşitli akademik bilgilere ulaşabilirler. Üniversitenin kütüphaneleri, geniş bir kitap ve süreli yayın koleksiyonuna sahiptir. Öğrenciler, kütüphanelerdeki basılı ve elektronik kaynaklardan faydalanarak araştırma yapabilmektedirler. Ayrıca, kütüphanelerde öğrencilere araştırma konusunda destek sağlayan bilgi ve belge hizmetleri sunulmaktadır.