Sinop Üniversitesi'nde eğitim sistemi, öğrencilerin akademik ve kişisel gelişimlerini desteklemeye yönelik olarak yapılandırılmıştır. Üniversite, lisans, yüksek lisans ve doktora programları sunmakta olup, Bologna sürecine uyumlu bir eğitim modeli benimsemektedir. Dersler, teorik bilgilerin yanı sıra uygulamalı çalışmaları da içermektedir. Öğrenciler, laboratuvar çalışmaları, proje ve staj imkanlarıyla pratik deneyim kazanma fırsatı bulmaktadır. Eğitim dili Türkçe olup, bazı bölümlerde İngilizce dersler de sunulmaktadır. Üniversite, öğrencilere çift ana dal ve yan dal programları ile farklı disiplinlerde eğitim alma imkanı tanımaktadır. Ayrıca, öğrenci değişim programları ve uluslararası işbirlikleri ile küresel düzeyde deneyim kazandırmayı hedeflemektedir. Eğitim süreci boyunca öğrencilere akademik danışmanlık hizmeti sunularak, bireysel ihtiyaçlarına yönelik destek sağlanmaktadır.