Trakya Üniversitesi'nde eğitim sistemi, öğrencilere geniş bir yelpazede akademik programlar sunan ve disiplinler arası bir yaklaşımla tasarlanmıştır. Üniversite, lisans, yüksek lisans ve doktora düzeyinde çeşitli programlar sunarak öğrencilere kapsamlı bir eğitim imkanı sağlamaktadır. Eğitim dili genellikle Türkçe olup, bazı programlarda İngilizce eğitim de verilmektedir. Öğrenciler, teorik bilgi ile uygulamalı deneyimi birleştiren dersler ve laboratuvar çalışmaları ile donanımlı hale getirilmektedir. Ayrıca, üniversite bünyesinde yer alan araştırma merkezleri ve laboratuvarlar, öğrencilerin araştırma ve geliştirme faaliyetlerine katılmalarına olanak tanımaktadır. Öğrenciler, Erasmus+ ve diğer öğrenci değişim programları ile yurtdışında eğitim görme ve farklı kültürleri deneyimleme fırsatı bulmaktadır. Üniversitenin eğitim sistemi, öğrencilere mesleki ve kişisel gelişimlerini destekleyen çeşitli seminerler, atölyeler ve projeler sunarak, onların kariyer hedeflerine ulaşmalarına yardımcı olmaktadır.