Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi'nde eğitim sistemi, lisans, lisansüstü ve ön lisans programları ile öğrencilere geniş bir akademik yelpaze sunmaktadır. Üniversite, Bologna sürecine uyumlu olarak Avrupa Kredi Transfer Sistemi (ECTS) ile dersleri yapılandırmıştır. Bu sayede öğrencilere, eğitimleri boyunca ulusal ve uluslararası hareketlilik imkânları sağlanmaktadır. Ders programları, teorik ve uygulamalı dersler ile laboratuvar çalışmaları, stajlar ve projeleri kapsayacak şekilde düzenlenmiştir. Öğrencilere, akademik başarılarının yanı sıra, kişisel ve mesleki gelişimlerini desteklemek amacıyla çeşitli seminerler, konferanslar ve workshoplar da sunulmaktadır. Üniversite, aynı zamanda uzaktan eğitim imkânları ile öğrencilere esnek bir öğrenme ortamı sağlamaktadır. Eğitim programları, alanında uzman akademik kadro tarafından yürütülmekte olup, öğrencilerin bilgi ve becerilerini en üst düzeye çıkarmayı hedeflemektedir.