Beykoz Üniversitesi, belirli bölümler için ulusal ve uluslararası akreditasyonlara sahiptir. Özellikle Mühendislik ve Mimarlık Fakültesi'nde yer alan Yazılım Mühendisliği programı, Türkiye Yükseköğretim Kurulu (YÖK) tarafından tanınan ve akredite edilen bir programdır. Ayrıca, uluslararası alanda tanınmış akreditasyon kuruluşları olan Mühendislik Eğitim Programları Değerlendirme ve Akreditasyon Derneği (MÜDEK) ve Accreditation Board for Engineering and Technology (ABET) akreditasyon şartlarını karşılamaktadır.
Beykoz Üniversitesi'nin eğitim programları, Avrupa Kredi Transfer ve Biriktirme Sistemi (AKTS) ile uyumludur ve bu sistemin kalite güvencesi araçlarını kullanarak tasarlanmış ve uygulanmaktadır. Bu sayede, öğrencilerin aldıkları eğitim uluslararası standartlara uygun hale getirilmekte ve mezunların diplomaları uluslararası alanda tanınmaktadır.
Üniversite, öğrencilere uluslararası tanınırlık sağlayan "Diploma Supplement" ve "Europass" belgeleri sunarak mezunlarının yurtdışında tanınmasını ve iş bulmalarını kolaylaştırmaktadır. Bu belgeler, Bologna Süreci çerçevesinde düzenlenmekte olup, öğrencilerin aldıkları eğitim ve kazandıkları yetkinliklerin uluslararası alanda anlaşılabilir olmasını sağlar.