Necmettin Erbakan Üniversitesi, 14 Temmuz 2010 tarihinde 6005 sayılı Kanun ile Konya Üniversitesi adıyla kurulmuş ve kuruluşu 21 Temmuz 2010 tarih ve 27648 sayılı Resmi Gazete’de yayımlanmıştır. Üniversite, başlangıçta bünyesinde 6 fakülte (Eğitim Bilimleri Fakültesi, Fen Fakültesi, Havacılık ve Uzay Bilimleri Fakültesi, Mühendislik Mimarlık Fakültesi, Sosyal ve Beşeri Bilimler Fakültesi, Turizm Fakültesi), 3 enstitü (Eğitim Bilimleri Enstitüsü, Fen Bilimleri Enstitüsü, Sosyal Bilimler Enstitüsü) ve 1 yüksekokul (Yabancı Diller Yüksekokulu) barındırmaktaydı.
2011 yılında, 2011/2620 sayılı Bakanlar Kurulu Kararı ile Selçuk Üniversitesi Rektörlüğü bünyesindeki Ahmet Keleşoğlu Eğitim Fakültesi, Ahmet Keleşoğlu İlahiyat Fakültesi ve Meram Tıp Fakültesi Necmettin Erbakan Üniversitesi'ne bağlanmıştır. 2012 yılında, 6287 sayılı Kanun ile üniversitenin adı Necmettin Erbakan Üniversitesi olarak değiştirilmiştir. Aynı yıl içinde Diş Hekimliği Fakültesi, Güzel Sanatlar Fakültesi, Sağlık Bilimleri Fakültesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Türk Müziği Devlet Konservatuvarı ve Uygulamalı Bilimler Yüksekokulu kurulmuştur.
2013 yılında, 2013/4480 sayılı Bakanlar Kurulu Kararı ile Selçuk Üniversitesi bünyesindeki Seydişehir Ahmet Cengiz Mühendislik Fakültesi, Ereğli Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Ereğli Eğitim Fakültesi, Seydişehir Meslek Yüksekokulu, Seydişehir Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu ve Konya Ereğli Kemal Akman Meslek Yüksekokulu üniversiteye bağlanmıştır. Aynı yıl, Eğitim Bilimleri Fakültesi kapatılarak Adalet Meslek Yüksekokulu kurulmuştur.
2014 yılında Ereğli Adalet Meslek Yüksekokulu, 2015 yılında Hukuk Fakültesi kurulmuştur. 2017 yılında Siyasal Bilgiler Fakültesi, Seydişehir Sağlık Bilimleri Fakültesi ve Meram Meslek Yüksekokulu kurulmuş, Uygulamalı Bilimler Yüksekokulu ise Uygulamalı Bilimler Fakültesi’ne dönüştürülmüştür. 2018 yılında Hemşirelik Fakültesi, 2019 yılında Ereğli Veteriner Fakültesi ile Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu kurulmuş, 2020 yılında Ereğli Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Ziraat Fakültesi'ne dönüştürülmüştür.
20 Haziran 2021 tarihli ve 4180 sayılı Cumhurbaşkanı Kararı ile Sağlık Bilimleri Fakültesi'nin adı Nezahat Keleşoğlu Sağlık Bilimleri Fakültesi olarak değiştirilmiştir. Konya Sanayi Odası iş birliğiyle Organize Sanayi Bölgesi içerisinde Teknik Bilimler Meslek Yüksekokulu kurulması teklifi, 30 Aralık 2021 tarihli Yükseköğretim Genel Kurul toplantısında kabul edilmiştir. 30 Nisan 2023 tarihli ve 7202 sayılı Cumhurbaşkanı Kararı ile Meram Tıp Fakültesi'nin adı Tıp Fakültesi olarak değiştirilmiştir.