Yakın Doğu Üniversitesi, ulusal ve uluslararası düzeyde birçok akreditasyona sahiptir. Bu akreditasyonlar, üniversitenin sunduğu eğitimin kalitesini ve standartlarını tescil etmektedir.
- Tıp Fakültesi: Dünya Tıp Eğitimi Federasyonu (WFME) tarafından akredite edilmiştir.
- Diş Hekimliği Fakültesi: Avrupa Diş Hekimliği Eğitimi Birliği (ADEE) tarafından akredite edilmiştir.
- Eczacılık Fakültesi: Avrupa Eczacılık Fakülteleri Birliği (EAFP) tarafından akredite edilmiştir.
- Mühendislik Fakültesi: MÜDEK (Mühendislik Eğitim Programları Değerlendirme ve Akreditasyon Derneği) tarafından akredite edilmiştir.
- İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi: Avrupa İşletme Geliştirme Derneği (EFMD) tarafından akredite edilmiştir.