Fenerbahçe Üniversitesi, Fenerbahçe Eğitim, Kültür ve Sağlık Vakfı tarafından kurulmuş olup, 24 Kasım 2016 tarihli Resmî Gazete’de yayımlanan kanun ile tüzel kişiliğini kazanmıştır. Üniversite, lisans düzeyinde toplam altı fakülte bünyesinde 28 bölümde ve Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu bünyesinde 14 programda eğitim-öğretime devam etmektedir. Lisansüstü Eğitim Enstitüsü’nde ise 10 yüksek lisans ve 2 doktora programı bulunmaktadır.
Kurulduğu tarihten itibaren öğretim elemanı kadrosunu güçlendiren Fenerbahçe Üniversitesi, İngilizce ön lisans ve lisans program sayısını arttırmış, yabancı diller bölümünü yapılandırarak öğrencilerine hazırlık ve sonrası öğrenim yıllarında güçlü dil öğrenimi fırsatı sunmuştur. Üniversite, süreli yayımlanan Sağlık, Sosyal, Spor Bilimleri ile Mimarlık ve Mühendislik alanlarındaki uluslararası bilimsel dergiler ile bilimsel çalışmalara yön vermektedir.
Fenerbahçe Üniversitesi, YÖK UYGAR kapsamında kurulmuş olan Afrika Çalışmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi, Avrupa Çalışmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi, İnovasyon ve Teknoloji Uygulama ve Araştırma Merkezi, Siber Alan Çalışmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi, Spor Araştırmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi, Sürekli Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi, Türkçe Öğretimi Uygulama ve Araştırma Merkezi ve Uzaktan Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi ile uygulama ve araştırma faaliyetlerini sürdürmektedir. Bu sekiz merkez sayesinde uluslararası iş birlikleri, proje çalışmaları ve değişim programları etkin olmaya başlamıştır. Ayrıca, üniversite Erasmus+ değişim programına kabul edilmiş ve ikili anlaşmalar yapılmaya başlanmıştır.
Fenerbahçe Üniversitesi, dünya dillerine hâkim, inovatif ve yaratıcı düşünceye açık, bilimsel gelişime odaklanmış, sosyal ve akademik gelişimini tamamlamış bireyler yetiştirmek ve dünyanın önde gelen üniversiteleri arasında yer almak hedefini benimsemiştir. Uluslararasılaşma hedefiyle hareket eden üniversite, uluslararası öğrencilere eğitim-öğretim fırsatı sunarken, çok kültürlülüğü ve çeşitliliği benimseyen bir öğrenme ortamı yaratarak uluslararası alanda saygın bir üniversite olma yolunda kararlılıkla ilerlemektedir. Bu bağlamda, yabancı öğrenci ve öğretim elemanı sayısı her geçen gün artmaktadır.