Fenerbahçe Üniversitesi, İstanbul'da tek bir ana kampüse sahiptir. Bu kampüs, Ataşehir ilçesinde, Kadıköy’e yakın bir konumda yer almakta ve 3 milyon 200 bin metrekarelik bir alan üzerine kuruludur. Kampüs, modern eğitim olanakları ve sosyal aktivitelerle donatılmıştır, bu da öğrencilere keyifli, güvenli ve kaliteli bir yaşam sunmaktadır. Kampüste, sınıflar, laboratuvarlar, kütüphaneler, spor tesisleri ve çeşitli öğrenci kulüpleri bulunmaktadır. Öğrenciler, hem akademik hem de sosyal anlamda kendilerini geliştirme fırsatı bulmaktadırlar.
Kampüse ulaşım oldukça kolaydır. İstanbul’un çeşitli bölgelerinden toplu taşıma araçları ile Ataşehir’deki ana kampüse rahatça erişim sağlanabilir. Kadıköy, Üsküdar ve diğer merkezi noktalardan otobüs, minibüs ve metro hatlarıyla kampüse ulaşmak mümkündür