Trabzon Üniversitesi'nde eğitim sistemi, öğrencilere teorik ve pratik bilgileri harmanlayarak sunmayı amaçlamaktadır. Üniversitenin tüm fakülte ve bölümlerinde, alanında uzman akademik kadro tarafından verilen dersler, öğrencilerin mesleki ve akademik yetkinliklerini geliştirmeyi hedeflemektedir. Eğitim sistemi, lisans, yüksek lisans ve doktora programları şeklinde yapılandırılmıştır. Öğrenciler, derslerin yanı sıra laboratuvar çalışmaları, stajlar ve saha araştırmaları gibi uygulamalı eğitim olanaklarından yararlanabilmektedir. Ayrıca üniversite, öğrenci değişim programları ve uluslararası işbirlikleri ile öğrencilerine yurt dışı eğitim ve staj imkanları sunmaktadır. Eğitim süresince öğrencilerin gelişimini desteklemek amacıyla düzenli olarak seminerler, konferanslar ve workshoplar düzenlenmektedir. Üniversite, öğrencilere bireysel gelişimlerini destekleyici çift ana dal ve yan dal programları sunarak, çok yönlü bir eğitim ortamı sağlamaktadır.