Balıkesir Üniversitesi'nde eğitim sistemi, öğrencilere geniş bir akademik yelpazede eğitim ve öğretim fırsatları sunmaktadır. Üniversitede lisans, yüksek lisans ve doktora programları, Bologna Süreci'ne uygun olarak yürütülmekte ve Avrupa Kredi Transfer Sistemi (AKTS) uygulanmaktadır. Bu sistem sayesinde öğrenciler, aldıkları dersleri Avrupa'daki diğer üniversitelerde de geçerli saydırabilmektedir. Eğitim, teorik derslerin yanı sıra pratik uygulamalar, laboratuvar çalışmaları, staj ve projelerle desteklenmektedir. Öğrencilerin bireysel gelişimlerini desteklemek amacıyla, ders dışı etkinlikler, seminerler ve atölye çalışmaları düzenlenmektedir. Akademik kadro, alanında uzman öğretim üyelerinden oluşmakta ve öğrencilerin eğitim süreçlerinde danışmanlık hizmetleri sunmaktadır. Üniversite, öğrencilere çağdaş bir eğitim ortamı sağlayarak, onların mesleki ve kişisel gelişimlerini desteklemektedir.