Giresun Üniversitesi, 1 Mart 2006 tarihinde, 2809 sayılı Yükseköğretim Teşkilat Kanunu'na eklenen 65. Madde ve 5467 sayılı Kanun ile kurulmuştur. Bu kanun kapsamında, Karadeniz Teknik Üniversitesi’ne bağlı olan Giresun Eğitim Fakültesi, Fen Edebiyat Fakültesi, İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi, Giresun Meslek Yüksekokulu, Tirebolu Meslek Yüksekokulu ve Sağlık Yüksekokulu ile Cumhuriyet Üniversitesi’ne bağlı Alucra Meslek Yüksekokulu ve Şebinkarahisar Meslek Yüksekokulu Giresun Üniversitesi’ne bağlanmıştır. Aynı süreçte Fen Bilimleri Enstitüsü ve Sosyal Bilimler Enstitüsü de kurulmuştur.
Giresun Üniversitesi’ne bağlanan Eğitim Fakültesi'nin temelleri, 1962 yılında kurulan üç yıllık Kız Öğretmen Okulu’na dayanmaktadır. Bu okul, yıllar içinde çeşitli isim ve statülerle faaliyetlerini sürdürmüş, son olarak Giresun Üniversitesi'ne bağlanmıştır. Fen Edebiyat Fakültesi 1998 yılında, İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi ise 2003 yılında kurulmuş ve daha sonra Giresun Üniversitesi'ne dahil edilmiştir. Sağlık Yüksekokulu 1992-1993 eğitim-öğretim yılında faaliyete geçmiş, 2006 yılında Giresun Üniversitesi'ne bağlanmış ve 15 Ekim 2008 tarihli Bakanlar Kurulu kararıyla Sağlık Bilimleri Fakültesi adını almıştır.
Bugün Giresun Üniversitesi, 13 fakülte, 3 enstitü, 5 yüksekokul, 1 devlet konservatuvarı, 13 meslek yüksekokulu, 21 uygulama ve araştırma merkezi ve 5 bölüm ile toplam 19 yerleşkede eğitim öğretim vermektedir. Merkez yerleşkeleri Güre, Gazipaşa, Sahil Sosyal Tesisler, Merkez Rektörlük ve Gazi Caddesi’nde; ilçe yerleşkeleri ise Alucra, Bulancak, Dereli, Espiye, Eynesil, Görele, Keşap, Piraziz, Şebinkarahisar ve Tirebolu’da bulunmaktadır. Üniversite, 171 ön lisans, 99 lisans, 44 yüksek lisans ve 10 doktora programı olmak üzere toplam 324 programla faaliyetlerini sürdürmektedir.
Giresun Üniversitesi, 1022 akademik, 379 idari, 34 sözleşmeli ve 235 sürekli işçi olmak üzere toplam 1670 personel ve 11.403 ön lisans, 14.046 lisans ve 1.580 lisansüstü öğrenci olmak üzere toplam 27.029 öğrenci ile eğitim-öğretim hizmeti vermektedir. 2006-2019 yılları arasında 49.638 öğrenci mezun olmuş ve 5.278 kişi Pedagojik Formasyon Sertifikası almaya hak kazanmıştır.