İstanbul Medipol Üniversitesi, öğrencilere geniş bir eğitim yelpazesi sunmaktadır. Üniversitenin eğitim sistemi, teorik bilgiyi pratik uygulamalarla birleştirerek öğrencilerin hem akademik hem de mesleki yetkinlikler kazanmalarını hedeflemektedir. Lisans, yüksek lisans ve doktora programları mevcuttur ve öğrencilerin ilgi alanlarına ve kariyer hedeflerine göre çeşitli seçenekler sunulmaktadır. Fakültelerdeki eğitim programları, Bologna Süreci'ne uygun olarak tasarlanmış ve Avrupa Kredi Transfer Sistemi (ECTS) ile uyumludur. Bu sayede, öğrencilerin yurt içi ve yurt dışında ders transferi yapmaları mümkündür.
Üniversitede teorik derslerin yanı sıra laboratuvar çalışmaları, stajlar, saha çalışmaları ve projeler gibi uygulamalı eğitim yöntemlerine de önem verilmektedir. Proje tabanlı öğrenme ve problem çözme gibi öğrenci merkezli öğretim yöntemleri yaygın olarak kullanılmaktadır. Öğrencilerin akademik başarıları, yazılı ve sözlü sınavlar, proje sunumları, ödevler ve uygulamalı sınavlar gibi çeşitli değerlendirme yöntemleri ile ölçülmektedir. Değerlendirme süreçleri, şeffaf ve adil bir şekilde yürütülmekte olup, öğrencilerin gelişimini sürekli olarak izlemeye yönelik bir yapıya sahiptir.
İstanbul Medipol Üniversitesi, uluslararası deneyimler kazandırmak amacıyla Erasmus+ programı kapsamında birçok Avrupa ülkesindeki üniversitelerle işbirliği yapmaktadır. Ayrıca, çeşitli ülkelerle ikili anlaşmalar ve uluslararası işbirlikleri sayesinde öğrenciler farklı kültürlerde eğitim alma ve staj yapma imkanına sahiptir. Dijital teknolojilerin eğitimde kullanımı desteklenmektedir. Online dersler, e-öğrenme platformları ve dijital kütüphane kaynakları, öğrencilere esnek ve erişilebilir öğrenme olanakları sunmaktadır.