Kafkas Üniversitesi'nde eğitim sistemi, öğrenci merkezli ve katılımcı bir anlayışla yapılandırılmıştır. Üniversite, lisans ve lisansüstü programlarda teorik bilgi ile uygulamayı dengeli bir şekilde sunmayı amaçlamaktadır. Eğitim-öğretim süreci, alanında uzman akademik kadro tarafından yürütülmekte ve güncel bilgiye erişimi kolaylaştıran kaynaklar kullanılmaktadır. Öğrenciler, derslerin yanı sıra laboratuvar çalışmaları, stajlar ve proje tabanlı öğrenme yöntemleri ile mesleki becerilerini geliştirme imkânı bulmaktadır. Ayrıca, çeşitli seminerler, konferanslar ve çalıştaylar ile öğrencilerin akademik ve kişisel gelişimleri desteklenmektedir. Öğrencilerin farklı alanlarda bilgi ve beceri kazanmalarını sağlamak amacıyla çift ana dal ve yan dal programları da sunulmaktadır. Eğitim dili, programların gereksinimlerine göre Türkçe ve İngilizce olarak belirlenmekte ve gerekli dil destekleri sağlanmaktadır.