Çankırı Karatekin Üniversitesi’nin kökleri, “Adı kendinden büyük şehir” Çankırı’da 788 yıl önce (1235-2023) filizlenen Darüşşifa’ya dayanmaktadır. Anadolu Selçuklu Valisi Atabey Cemaleddin Ferruh tarafından 1235 yılında Çankırı’da inşa edilen Darüşşifa, şehrin ilk yükseköğretim kurumu olup günümüz eğitim-araştırma hastanelerinin temelini oluşturmaktadır. Atabey Cemaleddin Ferruh, Darüşşifa’ya ilave olarak 1243 yılında Darülhadis’i inşa etmiştir. Hadis alanında öğretim yapan bu yükseköğretim kurumu, Anadolu’da kurulan ilk Darülhadistir. 1400’lü yıllarda ise bu yapıların bünyesine Mevlevihane eklenmiştir. Cumhuriyetin ilk yıllarında yıpranıp yıkılan bu mekanlar, 2018 yılında aslına uygun olarak restore edilerek Çankırı Karatekin Üniversitesi’ne tahsis edilmiştir.
Cumhuriyet döneminde Çankırı’da ilk yükseköğretim kurumu olarak 1975 yılında Eğitim Enstitüsü kurulmuş, ardından 1976 yılında Meslek Yüksekokulu açılarak Ankara Üniversitesi’ne bağlanmıştır. Çankırı halkı, üniversite hayalini gerçekleştirme konusunda kararlı olup, 1995 yılında Üniversite Vakfını kurarak bu hedef doğrultusunda çalışmalarını teşkilatlandırmıştır. 2006 yılında Gazi Üniversitesi çatısı altında İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi ve Güzel Sanatlar Fakültesi kurulmuştur. Nihayet 2007 yılında, dönemin Başbakanı ve Cumhurbaşkanı Recep Tayyip Erdoğan tarafından Çankırı Karatekin Üniversitesi'nin kurulacağı müjdesi verilmiştir.
2014 yılında büyük bölümü Uluyazı Kampüsüne taşınan Çankırı Karatekin Üniversitesi, geçen süre zarfında büyümüş ve gelişmiş, Türkiye’de ve dünyada bilinen, güvenilen, beğenilen ve tercih edilen bir yükseköğretim kurumu haline gelmiştir. 4500 öğrenciyle başladığı yolculuğuna bugün itibariyle 21.000 öğrenciyle devam eden üniversite, uluslararasılaşma yolunda da büyük adımlar atmıştır. Yabancı uyruklu öğrenci sayısının artması, Erasmus hareketlilikleri, sosyal ve kültürel aktiviteler ile milli ve manevi değerlere sahip çıkması, Çankırı Karatekin Üniversitesi'ni öne çıkarmaktadır.
Çankırı Karatekin Üniversitesi, 10 fakülte, 7 meslek yüksekokulu, 6 enstitü ve 14 uygulama ve araştırma merkezi ile hizmet vermektedir. Ilgaz Dağı’nın eteklerinde konumlanan üniversite, ilmin zirvesi olma yolunda emin adımlarla ilerlemektedir.