Öğrencilerin beden ve ruh sağlıklarını korumak, geliştirmek ve sosyalleşmelerine katkıda bulunmak amacıyla belirlenen program kapsamında çeşitli spor etkinlikleri düzenlenmektedir. Basketbol, voleybol, futbol, güreş, masa tenisi, badminton, kort tenisi, salon futbolu, karate, cimnastik, judo, muay thai, taekwondo ve kick boks gibi spor dallarında faaliyetler yönetilmekte ve ulusal ve uluslararası yarışmalarda üniversiteyi temsil etmektedir.
Öğrencilerin eğlenceli vakit geçirmeleri ve spor yapmaları için step aerobik, zumba, trekking ve paintball gibi etkinlikler de düzenlenmektedir.
Her yıl düzenlenen Çankırı Karatekin Üniversitesi Geleneksel Spor Oyunları'na yaklaşık 300 öğrenci katılmaktadır. Basketbol, voleybol, futsal, masa tenisi ve badminton gibi branşlarda yapılan yarışmalarda fakülte ve yüksekokulların takımları birbirleriyle rekabet etmektedir.
Üniversitede 3 kapalı spor salonu, 2 sağlıklı yaşam merkezi (fitness salonu), 1 step aerobik salonu, 1 cimnastik salonu, 1 uzak doğu ve boks salonu, 1 güreş salonu bulunmaktadır. Bu tesisler öğrencilerin spor yapmaları ve bedensel aktivitelerde bulunmaları için kullanıma açıktır.