Kıbrıs İlim Üniversitesi eğitim sistemi, Avrupa Kredi Transfer Sistemi (ECTS) üzerine kuruludur. Bu sistem, öğrenci merkezli bir kredi sistemidir ve öğrencilerin belirli bir programın hedeflerine ulaşmak için gereken iş yüküne dayalı olarak kredilerin tahsis edilmesini sağlar. Bu sistem, öğretim programlarının daha şeffaf hale gelmesini ve öğrenci hareketliliğini artırmayı amaçlamaktadır. Böylece, öğrencilerin yurt dışında aldıkları eğitimin kendi ülkelerinde tanınması kolaylaştırılmaktadır.
Kıbrıs İlim Üniversitesi, eğitim ve öğretim süreçlerinde ECTS sistemini referans alarak, öğretim programlarını ve ders içeriklerini öğrenci iş yüküne göre tasarlar, uygular, gözden geçirir ve geliştirir. Bu süreç, eğitim kalitesinin artırılmasına ve kalite güvencesine önemli katkı sağlamaktadır. Ayrıca, üniversitenin eğitim bilgi sistemi (ETIS), tüm akademik ve idari personelin aktif ve etkili katılımını sağlamak üzere tasarlanmıştır.
Üniversitede lisans, yüksek lisans ve doktora programları sunulmaktadır. Öğrenciler, kayıt işlemleri ve akademik rehberlik konusunda destek almaktadır. Ayrıca, daha önce alınan derslerin tanınması ve kredi transferi işlemleri de yapılmaktadır.