Kırklareli Üniversitesi, çift ana dal ve yan dal programları sunmaktadır. Bu programlar, öğrencilere belirli bir alanda derinlemesine bilgi edinme ve farklı disiplinler arası bağlantılar kurma fırsatı sunar.
Çift ana dal programı, öğrencinin iki farklı ana dalda eğitim almasını sağlar. Öğrenciler, iki farklı alanda dersler alarak mezuniyetlerinde her iki alanda da bir diploma almaya hak kazanırlar.
Yan dal programı ise, öğrencinin ana dalının yanında belirli bir konuda uzmanlaşmasını sağlar. Öğrenciler, ana dal derslerinin yanı sıra ilgi duydukları bir alanda ek dersler alarak bu alanda bir yan dal sertifikası veya diploma alabilirler.