Kırklareli Üniversitesi'nde eğitim sistemi, öğrencilere çağdaş akademik bilgi ve beceriler kazandırmayı hedefleyen yapıdadır. Üniversite, lisans, yüksek lisans ve doktora programları ile geniş bir yelpazede eğitim imkanı sunmaktadır. Eğitim-öğretim programları, Bologna sürecine uygun olarak düzenlenmiş olup, öğrencilerin uluslararası düzeyde tanınan diplomalar almalarını sağlamaktadır. Teorik dersler ile uygulamalı eğitimlerin dengeli bir şekilde verildiği programlar, öğrencilerin alanlarında donanımlı bir şekilde mezun olmalarını amaçlamaktadır. Ayrıca, üniversitenin sunduğu staj ve uygulama imkanları, öğrencilerin mesleki deneyim kazanmalarına olanak tanımaktadır. Eğitim sürecinde, öğrenci merkezli bir yaklaşım benimsenmekte olup, öğrencilerin bireysel gelişimleri ve akademik başarıları yakından takip edilmektedir. Öğretim elemanlarının rehberliğinde gerçekleştirilen projeler ve araştırma faaliyetleri, öğrencilerin bilimsel düşünme ve problem çözme becerilerini geliştirmektedir.