Samsun Üniversitesi'nde eğitim sistemi, öğrenci merkezli bir yaklaşımı benimseyerek teorik ve uygulamalı eğitimi bir arada sunmaktadır. Üniversitede lisans ve lisansüstü programlar, ilgili fakülte ve yüksekokullarda uzman akademik kadrolar tarafından verilmektedir. Eğitim-öğretim programları, güncel bilimsel gelişmelere ve sektör ihtiyaçlarına göre sürekli olarak güncellenmekte, öğrencilerin mesleki bilgi ve becerilerle donatılmaları hedeflenmektedir. Dersler, hem sınıf içi eğitim hem de laboratuvar, atölye çalışmaları ve staj gibi uygulamalı faaliyetlerle desteklenmektedir. Ayrıca, öğrencilere çift ana dal ve yan dal programları ile farklı alanlarda kendilerini geliştirme imkanı sunulmakta ve uluslararası değişim programları ile küresel deneyimler kazanmaları teşvik edilmektedir. Eğitim sisteminde değerlendirmeler, ara sınavlar, final sınavları, proje ve ödevler gibi çeşitli yöntemlerle yapılmakta ve öğrencilerin başarısı düzenli olarak takip edilmektedir.